Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA10O75578 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA10O75578 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA10O75578 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA10O75578 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA10O75578 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA10O75578 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA10O75578 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA10O75578 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA10O75578 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms