Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGA10O75578 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGA10O75578 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGA10O75578 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGA10O75578 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGA10O75578 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA10O75578 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGA10O75578 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGA10O75578 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA10O75578 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGA10O75578 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGA10O75578 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGA10O75578 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA10O75578 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA10O75578 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA10O75578 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA10O75578 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA10O75578 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGA10O75578 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGA10O75578 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA10O75578 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGA10O75578 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA10O75578 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA10O75578 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA10O75578 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA10O75578 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA10O75578 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA10O75578 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA10O75578 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA10O75578 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA10O75578 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA10O75578 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA10O75578 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA10O75578 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA10O75578 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA10O75578 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA10O75578 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA10O75578 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA10O75578 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA10O75578 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA10O75578 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA10O75578 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA10O75578 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA10O75578 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA10O75578 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA10O75578 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA10O75578 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA10O75578 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA10O75578 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA10O75578 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA10O75578 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA10O75578 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA10O75578 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA10O75578 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA10O75578 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA10O75578 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA10O75578 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA10O75578 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA10O75578 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA10O75578 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA10O75578 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA10O75578 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA10O75578 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA10O75578 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA10O75578 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA10O75578 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA10O75578 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA10O75578 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGA10O75578 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA10O75578 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA10O75578 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA10O75578 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA10O75578 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA10O75578 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA10O75578 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA10O75578 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA10O75578 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA10O75578 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA10O75578 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA10O75578 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA10O75578 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA10O75578 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA10O75578 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA10O75578 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA10O75578 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA10O75578 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA10O75578 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA10O75578 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA10O75578 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA10O75578 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA10O75578 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA10O75578 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA10O75578 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA10O75578 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA10O75578 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA10O75578 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA10O75578 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA10O75578 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA10O75578 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA10O75578 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms