Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
KIAA0556O60303 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
KIAA0556O60303 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
KIAA0556O60303 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
KIAA0556O60303 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
KIAA0556O60303 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
KIAA0556O60303 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
KIAA0556O60303 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
KIAA0556O60303 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
KIAA0556O60303 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.31■■■■■ 4.84
KIAA0556O60303 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
KIAA0556O60303 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
KIAA0556O60303 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
KIAA0556O60303 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
KIAA0556O60303 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
KIAA0556O60303 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
KIAA0556O60303 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
KIAA0556O60303 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
KIAA0556O60303 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
KIAA0556O60303 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
KIAA0556O60303 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
KIAA0556O60303 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
KIAA0556O60303 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
KIAA0556O60303 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
KIAA0556O60303 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
KIAA0556O60303 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
KIAA0556O60303 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
KIAA0556O60303 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
KIAA0556O60303 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
KIAA0556O60303 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
KIAA0556O60303 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
KIAA0556O60303 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
KIAA0556O60303 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
KIAA0556O60303 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
KIAA0556O60303 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
KIAA0556O60303 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
KIAA0556O60303 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
KIAA0556O60303 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
KIAA0556O60303 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
KIAA0556O60303 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
KIAA0556O60303 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
KIAA0556O60303 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
KIAA0556O60303 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
KIAA0556O60303 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
KIAA0556O60303 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
KIAA0556O60303 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
KIAA0556O60303 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
KIAA0556O60303 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
KIAA0556O60303 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
KIAA0556O60303 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
KIAA0556O60303 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.71
KIAA0556O60303 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
KIAA0556O60303 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
KIAA0556O60303 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
KIAA0556O60303 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
KIAA0556O60303 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
KIAA0556O60303 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
KIAA0556O60303 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
KIAA0556O60303 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
KIAA0556O60303 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
KIAA0556O60303 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
KIAA0556O60303 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
KIAA0556O60303 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
KIAA0556O60303 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
KIAA0556O60303 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
KIAA0556O60303 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms