Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH7O60245 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDH7O60245 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDH7O60245 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH7O60245 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH7O60245 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDH7O60245 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH7O60245 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDH7O60245 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH7O60245 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH7O60245 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH7O60245 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH7O60245 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH7O60245 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH7O60245 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms