Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST1O43916 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST1O43916 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST1O43916 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST1O43916 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST1O43916 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST1O43916 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST1O43916 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST1O43916 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST1O43916 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST1O43916 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST1O43916 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST1O43916 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST1O43916 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST1O43916 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST1O43916 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST1O43916 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST1O43916 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST1O43916 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST1O43916 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST1O43916 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST1O43916 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST1O43916 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST1O43916 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST1O43916 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST1O43916 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST1O43916 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST1O43916 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST1O43916 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST1O43916 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST1O43916 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST1O43916 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST1O43916 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST1O43916 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST1O43916 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST1O43916 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST1O43916 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST1O43916 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST1O43916 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST1O43916 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST1O43916 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST1O43916 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST1O43916 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST1O43916 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST1O43916 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST1O43916 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST1O43916 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST1O43916 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST1O43916 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST1O43916 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST1O43916 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST1O43916 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST1O43916 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST1O43916 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST1O43916 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST1O43916 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST1O43916 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST1O43916 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST1O43916 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST1O43916 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST1O43916 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST1O43916 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST1O43916 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST1O43916 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST1O43916 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST1O43916 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST1O43916 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST1O43916 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST1O43916 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST1O43916 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST1O43916 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST1O43916 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST1O43916 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST1O43916 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST1O43916 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST1O43916 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST1O43916 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST1O43916 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST1O43916 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST1O43916 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST1O43916 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST1O43916 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST1O43916 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST1O43916 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST1O43916 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST1O43916 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST1O43916 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST1O43916 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST1O43916 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST1O43916 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST1O43916 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST1O43916 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST1O43916 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST1O43916 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST1O43916 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST1O43916 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST1O43916 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST1O43916 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST1O43916 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHST1O43916 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms