Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TIMM44O43615 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TIMM44O43615 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TIMM44O43615 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TIMM44O43615 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TIMM44O43615 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TIMM44O43615 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIMM44O43615 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIMM44O43615 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIMM44O43615 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIMM44O43615 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIMM44O43615 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms