Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNAB3O43448 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNAB3O43448 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNAB3O43448 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNAB3O43448 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNAB3O43448 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNAB3O43448 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNAB3O43448 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNAB3O43448 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNAB3O43448 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNAB3O43448 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNAB3O43448 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNAB3O43448 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNAB3O43448 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms