Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNAB3O43448 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNAB3O43448 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNAB3O43448 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNAB3O43448 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNAB3O43448 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNAB3O43448 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNAB3O43448 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNAB3O43448 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNAB3O43448 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNAB3O43448 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNAB3O43448 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNAB3O43448 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNAB3O43448 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNAB3O43448 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNAB3O43448 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNAB3O43448 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNAB3O43448 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNAB3O43448 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNAB3O43448 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNAB3O43448 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNAB3O43448 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNAB3O43448 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNAB3O43448 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNAB3O43448 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNAB3O43448 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNAB3O43448 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNAB3O43448 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNAB3O43448 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNAB3O43448 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNAB3O43448 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNAB3O43448 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNAB3O43448 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNAB3O43448 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNAB3O43448 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB3O43448 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNAB3O43448 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNAB3O43448 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB3O43448 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB3O43448 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB3O43448 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNAB3O43448 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB3O43448 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB3O43448 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB3O43448 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNAB3O43448 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNAB3O43448 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNAB3O43448 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNAB3O43448 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNAB3O43448 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNAB3O43448 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNAB3O43448 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNAB3O43448 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNAB3O43448 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNAB3O43448 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNAB3O43448 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB3O43448 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB3O43448 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNAB3O43448 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNAB3O43448 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNAB3O43448 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB3O43448 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB3O43448 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNAB3O43448 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNAB3O43448 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNAB3O43448 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNAB3O43448 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNAB3O43448 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNAB3O43448 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNAB3O43448 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNAB3O43448 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNAB3O43448 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms