Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA2O43364 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA2O43364 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA2O43364 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA2O43364 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA2O43364 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA2O43364 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA2O43364 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA2O43364 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA2O43364 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA2O43364 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA2O43364 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HOXA2O43364 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA2O43364 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA2O43364 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HOXA2O43364 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA2O43364 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HOXA2O43364 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA2O43364 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA2O43364 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA2O43364 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA2O43364 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA2O43364 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA2O43364 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA2O43364 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA2O43364 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA2O43364 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA2O43364 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXA2O43364 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA2O43364 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA2O43364 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA2O43364 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA2O43364 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA2O43364 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA2O43364 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms