Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HOXA2O43364 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
HOXA2O43364 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HOXA2O43364 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HOXA2O43364 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HOXA2O43364 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HOXA2O43364 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HOXA2O43364 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HOXA2O43364 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HOXA2O43364 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HOXA2O43364 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HOXA2O43364 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HOXA2O43364 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HOXA2O43364 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
HOXA2O43364 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HOXA2O43364 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HOXA2O43364 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HOXA2O43364 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HOXA2O43364 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HOXA2O43364 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXA2O43364 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HOXA2O43364 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HOXA2O43364 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXA2O43364 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HOXA2O43364 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HOXA2O43364 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HOXA2O43364 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HOXA2O43364 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HOXA2O43364 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HOXA2O43364 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HOXA2O43364 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HOXA2O43364 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HOXA2O43364 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HOXA2O43364 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HOXA2O43364 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HOXA2O43364 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HOXA2O43364 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HOXA2O43364 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HOXA2O43364 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HOXA2O43364 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HOXA2O43364 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HOXA2O43364 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HOXA2O43364 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HOXA2O43364 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HOXA2O43364 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HOXA2O43364 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HOXA2O43364 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HOXA2O43364 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXA2O43364 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXA2O43364 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
HOXA2O43364 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA2O43364 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HOXA2O43364 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
HOXA2O43364 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXA2O43364 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXA2O43364 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXA2O43364 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HOXA2O43364 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HOXA2O43364 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXA2O43364 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXA2O43364 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HOXA2O43364 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HOXA2O43364 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HOXA2O43364 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXA2O43364 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HOXA2O43364 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXA2O43364 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXA2O43364 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HOXA2O43364 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXA2O43364 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HOXA2O43364 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXA2O43364 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXA2O43364 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HOXA2O43364 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXA2O43364 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXA2O43364 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXA2O43364 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HOXA2O43364 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXA2O43364 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXA2O43364 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXA2O43364 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXA2O43364 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXA2O43364 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXA2O43364 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXA2O43364 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXA2O43364 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXA2O43364 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HOXA2O43364 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA2O43364 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA2O43364 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXA2O43364 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HOXA2O43364 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms