Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAPBPO15533 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAPBPO15533 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAPBPO15533 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAPBPO15533 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TAPBPO15533 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAPBPO15533 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAPBPO15533 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAPBPO15533 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAPBPO15533 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAPBPO15533 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAPBPO15533 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAPBPO15533 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAPBPO15533 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAPBPO15533 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAPBPO15533 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAPBPO15533 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAPBPO15533 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAPBPO15533 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAPBPO15533 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAPBPO15533 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAPBPO15533 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAPBPO15533 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms