Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC16AO15027 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC16AO15027 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC16AO15027 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC16AO15027 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC16AO15027 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC16AO15027 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16AO15027 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC16AO15027 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC16AO15027 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC16AO15027 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC16AO15027 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC16AO15027 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC16AO15027 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC16AO15027 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC16AO15027 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC16AO15027 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC16AO15027 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC16AO15027 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC16AO15027 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC16AO15027 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC16AO15027 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC16AO15027 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC16AO15027 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms