Protein–RNA interactions for Protein: C9J1V9

EEF1E1-BLOC1S5, EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms