Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IDSB3KWA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IDSB3KWA1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IDSB3KWA1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IDSB3KWA1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IDSB3KWA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IDSB3KWA1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IDSB3KWA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IDSB3KWA1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IDSB3KWA1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IDSB3KWA1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IDSB3KWA1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IDSB3KWA1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IDSB3KWA1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IDSB3KWA1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IDSB3KWA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IDSB3KWA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IDSB3KWA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IDSB3KWA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IDSB3KWA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IDSB3KWA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms