Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HACD1B0YJ81 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HACD1B0YJ81 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACD1B0YJ81 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HACD1B0YJ81 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACD1B0YJ81 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACD1B0YJ81 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACD1B0YJ81 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACD1B0YJ81 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACD1B0YJ81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACD1B0YJ81 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACD1B0YJ81 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACD1B0YJ81 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACD1B0YJ81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACD1B0YJ81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACD1B0YJ81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACD1B0YJ81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HACD1B0YJ81 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HACD1B0YJ81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HACD1B0YJ81 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACD1B0YJ81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACD1B0YJ81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HACD1B0YJ81 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms