Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB19A4D1S5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB19A4D1S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB19A4D1S5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB19A4D1S5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB19A4D1S5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB19A4D1S5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB19A4D1S5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB19A4D1S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB19A4D1S5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB19A4D1S5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB19A4D1S5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB19A4D1S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB19A4D1S5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB19A4D1S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB19A4D1S5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB19A4D1S5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB19A4D1S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms