Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB19A4D1S5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB19A4D1S5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB19A4D1S5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB19A4D1S5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB19A4D1S5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB19A4D1S5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB19A4D1S5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB19A4D1S5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB19A4D1S5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB19A4D1S5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB19A4D1S5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB19A4D1S5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB19A4D1S5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB19A4D1S5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB19A4D1S5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB19A4D1S5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB19A4D1S5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB19A4D1S5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB19A4D1S5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB19A4D1S5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB19A4D1S5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB19A4D1S5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB19A4D1S5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB19A4D1S5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB19A4D1S5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB19A4D1S5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB19A4D1S5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB19A4D1S5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB19A4D1S5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB19A4D1S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB19A4D1S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB19A4D1S5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB19A4D1S5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB19A4D1S5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB19A4D1S5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB19A4D1S5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB19A4D1S5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB19A4D1S5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB19A4D1S5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB19A4D1S5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB19A4D1S5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB19A4D1S5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB19A4D1S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB19A4D1S5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB19A4D1S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB19A4D1S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB19A4D1S5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB19A4D1S5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB19A4D1S5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB19A4D1S5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB19A4D1S5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB19A4D1S5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB19A4D1S5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB19A4D1S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB19A4D1S5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB19A4D1S5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB19A4D1S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB19A4D1S5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB19A4D1S5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB19A4D1S5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB19A4D1S5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB19A4D1S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB19A4D1S5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB19A4D1S5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB19A4D1S5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB19A4D1S5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB19A4D1S5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB19A4D1S5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB19A4D1S5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB19A4D1S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB19A4D1S5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB19A4D1S5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB19A4D1S5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB19A4D1S5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB19A4D1S5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB19A4D1S5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB19A4D1S5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB19A4D1S5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB19A4D1S5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB19A4D1S5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB19A4D1S5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB19A4D1S5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB19A4D1S5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB19A4D1S5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB19A4D1S5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB19A4D1S5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB19A4D1S5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB19A4D1S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB19A4D1S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB19A4D1S5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB19A4D1S5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms