Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12DA2A288 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12DA2A288 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12DA2A288 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC3H12DA2A288 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12DA2A288 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12DA2A288 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12DA2A288 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12DA2A288 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12DA2A288 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12DA2A288 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12DA2A288 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12DA2A288 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12DA2A288 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12DA2A288 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12DA2A288 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms