Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTC26A0AVF1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTC26A0AVF1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TTC26A0AVF1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTC26A0AVF1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTC26A0AVF1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTC26A0AVF1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTC26A0AVF1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTC26A0AVF1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TTC26A0AVF1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TTC26A0AVF1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTC26A0AVF1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTC26A0AVF1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTC26A0AVF1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTC26A0AVF1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TTC26A0AVF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC26A0AVF1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
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