Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRBC2A0A5B9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRBC2A0A5B9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRBC2A0A5B9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRBC2A0A5B9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRBC2A0A5B9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRBC2A0A5B9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRBC2A0A5B9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRBC2A0A5B9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRBC2A0A5B9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRBC2A0A5B9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRBC2A0A5B9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRBC2A0A5B9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRBC2A0A5B9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRBC2A0A5B9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRBC2A0A5B9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBC2A0A5B9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRBC2A0A5B9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRBC2A0A5B9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRBC2A0A5B9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBC2A0A5B9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBC2A0A5B9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms