Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPI3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPI3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPI3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPI3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPI3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPI3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPI3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPI3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPI3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPI3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPI3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPI3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PPI3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPI3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPI3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms