Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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LSAMPQ13449 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LSAMPQ13449 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LSAMPQ13449 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LSAMPQ13449 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LSAMPQ13449 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LSAMPQ13449 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LSAMPQ13449 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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