Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms