Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FRMPD4Q14CM0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FRMPD4Q14CM0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FRMPD4Q14CM0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FRMPD4Q14CM0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
FRMPD4Q14CM0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FRMPD4Q14CM0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
FRMPD4Q14CM0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FRMPD4Q14CM0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD4Q14CM0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FRMPD4Q14CM0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FRMPD4Q14CM0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FRMPD4Q14CM0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FRMPD4Q14CM0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FRMPD4Q14CM0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FRMPD4Q14CM0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FRMPD4Q14CM0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FRMPD4Q14CM0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FRMPD4Q14CM0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD4Q14CM0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FRMPD4Q14CM0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
FRMPD4Q14CM0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD4Q14CM0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FRMPD4Q14CM0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRMPD4Q14CM0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FRMPD4Q14CM0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD4Q14CM0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD4Q14CM0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD4Q14CM0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FRMPD4Q14CM0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD4Q14CM0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD4Q14CM0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD4Q14CM0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FRMPD4Q14CM0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FRMPD4Q14CM0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRMPD4Q14CM0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FRMPD4Q14CM0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FRMPD4Q14CM0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
FRMPD4Q14CM0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FRMPD4Q14CM0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD4Q14CM0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FRMPD4Q14CM0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FRMPD4Q14CM0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FRMPD4Q14CM0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FRMPD4Q14CM0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FRMPD4Q14CM0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD4Q14CM0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FRMPD4Q14CM0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD4Q14CM0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD4Q14CM0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD4Q14CM0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD4Q14CM0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD4Q14CM0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FRMPD4Q14CM0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FRMPD4Q14CM0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FRMPD4Q14CM0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FRMPD4Q14CM0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FRMPD4Q14CM0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FRMPD4Q14CM0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMPD4Q14CM0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FRMPD4Q14CM0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FRMPD4Q14CM0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD4Q14CM0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FRMPD4Q14CM0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD4Q14CM0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD4Q14CM0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FRMPD4Q14CM0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FRMPD4Q14CM0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD4Q14CM0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRMPD4Q14CM0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD4Q14CM0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD4Q14CM0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD4Q14CM0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FRMPD4Q14CM0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
FRMPD4Q14CM0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FRMPD4Q14CM0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FRMPD4Q14CM0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FRMPD4Q14CM0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FRMPD4Q14CM0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FRMPD4Q14CM0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FRMPD4Q14CM0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FRMPD4Q14CM0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FRMPD4Q14CM0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FRMPD4Q14CM0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FRMPD4Q14CM0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FRMPD4Q14CM0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FRMPD4Q14CM0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FRMPD4Q14CM0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FRMPD4Q14CM0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRMPD4Q14CM0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD4Q14CM0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD4Q14CM0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FRMPD4Q14CM0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD4Q14CM0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD4Q14CM0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD4Q14CM0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD4Q14CM0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD4Q14CM0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD4Q14CM0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD4Q14CM0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms