Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK2Q9H0K1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK2Q9H0K1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms