Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF3Q9H094 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF3Q9H094 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms