Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C2orf88Q9BSF0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf88Q9BSF0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms