Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 220.27■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 517.44■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 27.5
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AGGF1Q8N302 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 512.21□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-323■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 322.63■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 27.5
AGGF1Q8N302 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.944e-17■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.514e-17■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 TM6SF1-206ENST00000564988 548 ntTSL 424.27■■□□□ 1.484e-17■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 TM6SF1-201ENST00000258909 1469 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.54e-17■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 TM6SF1-203ENST00000379384 1808 ntTSL 517.78■□□□□ 0.444e-17■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.824e-17■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 RRP36-201ENST00000244496 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 RRP36-202ENST00000607394 528 ntTSL 25.64□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 529.02■■■□□ 2.244e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.813e-16■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 MYCBP2-209ENST00000491491 649 ntTSL 523.98■■□□□ 1.434e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 YY1-202ENST00000553625 422 ntTSL 219.65■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 CACYBP-207ENST00000473925 804 ntTSL 219.34■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 CACYBP-208ENST00000483307 688 ntTSL 219.05■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 213.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-206ENST00000529544 447 ntTSL 212.68□□□□□ -0.383e-11■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 CACYBP-204ENST00000426793 499 ntTSL 312.44□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 512.07□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-239ENST00000483086 620 ntTSL 311.74□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 511.59□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 210.26□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 DNMT1-219ENST00000589349 603 ntTSL 49.88□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 BICD1-202ENST00000395758 3194 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 48.03□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 OSBPL3-211ENST00000441059 540 ntTSL 44.65□□□□□ -1.674e-6■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 FANCL-204ENST00000403676 849 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 27.3
AGGF1Q8N302 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 27.3
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AGGF1Q8N302 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 27.2
AGGF1Q8N302 LGR6-206ENST00000487787 3377 ntTSL 212.7□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 27.2
AGGF1Q8N302 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 27.2
AGGF1Q8N302 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.983e-7■■■■■ 27.2
AGGF1Q8N302 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.254e-10■■■■■ 27.2
AGGF1Q8N302 NAPA-219ENST00000601208 989 ntTSL 514.78□□□□□ -0.046e-10■■■■■ 27.1
AGGF1Q8N302 FAM239A-203ENST00000456563 793 ntTSL 317.77■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.96■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 ATG7-212ENST00000446110 435 ntTSL 35.26□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 CEP85L-210ENST00000483035 1585 ntTSL 28□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 CEP85L-207ENST00000462101 483 ntTSL 27.48□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 CEP85L-209ENST00000476150 620 ntTSL 46□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 27
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