RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529544.1

BRMS1-206, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-206ENST00000529544 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.54■■■□□ 2.48
BRMS1-206ENST00000529544 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.1■■□□□ 1.93
BRMS1-206ENST00000529544 ABCC9O60706 1549 aa26.19■■□□□ 1.78
BRMS1-206ENST00000529544 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
BRMS1-206ENST00000529544 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.46■■□□□ 1.67
BRMS1-206ENST00000529544 NACADO15069 1562 aa25.39■■□□□ 1.65
BRMS1-206ENST00000529544 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.37■■□□□ 1.65
BRMS1-206ENST00000529544 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.29■■□□□ 1.64
BRMS1-206ENST00000529544 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.28■■□□□ 1.64
BRMS1-206ENST00000529544 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.84■■□□□ 1.57
BRMS1-206ENST00000529544 SCRIBQ14160 1630 aa24.71■■□□□ 1.55
BRMS1-206ENST00000529544 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.52■■□□□ 1.52
BRMS1-206ENST00000529544 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
BRMS1-206ENST00000529544 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
BRMS1-206ENST00000529544 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
BRMS1-206ENST00000529544 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.73■■□□□ 1.39
BRMS1-206ENST00000529544 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.72■■□□□ 1.39
BRMS1-206ENST00000529544 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.71■■□□□ 1.39
BRMS1-206ENST00000529544 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
BRMS1-206ENST00000529544 SMARCA4P51532 1647 aa23.66■■□□□ 1.38
BRMS1-206ENST00000529544 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.52■■□□□ 1.36
BRMS1-206ENST00000529544 SMARCA2P51531 1590 aa23.48■■□□□ 1.35
BRMS1-206ENST00000529544 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.43■■□□□ 1.34
BRMS1-206ENST00000529544 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-206ENST00000529544 NCAPD3P42695 1498 aa23.37■■□□□ 1.33
BRMS1-206ENST00000529544 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
BRMS1-206ENST00000529544 WIZO95785 1651 aa23.34■■□□□ 1.33
BRMS1-206ENST00000529544 HMGXB3Q12766 1538 aa23.31■■□□□ 1.32
BRMS1-206ENST00000529544 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
BRMS1-206ENST00000529544 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
BRMS1-206ENST00000529544 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
BRMS1-206ENST00000529544 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.79■■□□□ 1.24
BRMS1-206ENST00000529544 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.77■■□□□ 1.24
BRMS1-206ENST00000529544 NESP48681 1621 aa22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-206ENST00000529544 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-206ENST00000529544 PRDM2Q13029 1718 aa22.64■■□□□ 1.21
BRMS1-206ENST00000529544 CFTRP13569 1480 aa22.63■■□□□ 1.21
BRMS1-206ENST00000529544 ERCC6Q03468 1493 aa22.6■■□□□ 1.21
BRMS1-206ENST00000529544 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.59■■□□□ 1.21
BRMS1-206ENST00000529544 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.55■■□□□ 1.2
BRMS1-206ENST00000529544 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.47■■□□□ 1.19
BRMS1-206ENST00000529544 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.43■■□□□ 1.18
BRMS1-206ENST00000529544 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-206ENST00000529544 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.33■■□□□ 1.16
BRMS1-206ENST00000529544 WDR62O43379 1518 aa22.24■■□□□ 1.15
BRMS1-206ENST00000529544 CUX2O14529 1486 aa22.23■■□□□ 1.15
BRMS1-206ENST00000529544 ABCC8Q09428 1581 aa22.21■■□□□ 1.15
BRMS1-206ENST00000529544 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
BRMS1-206ENST00000529544 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.16■■□□□ 1.14
BRMS1-206ENST00000529544 TOPBP1Q92547 1522 aa22.14■■□□□ 1.13
BRMS1-206ENST00000529544 CUX1P39880 1505 aa22.06■■□□□ 1.12
BRMS1-206ENST00000529544 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
BRMS1-206ENST00000529544 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.99■■□□□ 1.11
BRMS1-206ENST00000529544 TOP2BQ02880 1626 aa21.98■■□□□ 1.11
BRMS1-206ENST00000529544 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
BRMS1-206ENST00000529544 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.96■■□□□ 1.11
BRMS1-206ENST00000529544 SYNJ1O43426 1573 aa21.95■■□□□ 1.11
BRMS1-206ENST00000529544 IFT140Q96RY7 1462 aa21.95■■□□□ 1.1
BRMS1-206ENST00000529544 SOGA1O94964 1423 aa21.89■■□□□ 1.1
BRMS1-206ENST00000529544 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
BRMS1-206ENST00000529544 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-206ENST00000529544 WDR97A6NE52 1622 aa21.8■■□□□ 1.08
BRMS1-206ENST00000529544 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
BRMS1-206ENST00000529544 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
BRMS1-206ENST00000529544 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.75■■□□□ 1.07
BRMS1-206ENST00000529544 TRIM41Q8WV44 630 aa21.75■■□□□ 1.07
BRMS1-206ENST00000529544 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
BRMS1-206ENST00000529544 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
BRMS1-206ENST00000529544 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
BRMS1-206ENST00000529544 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.66■■□□□ 1.06
BRMS1-206ENST00000529544 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.65■■□□□ 1.06
BRMS1-206ENST00000529544 GRIN2BQ13224 1484 aa21.61■■□□□ 1.05
BRMS1-206ENST00000529544 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.61■■□□□ 1.05
BRMS1-206ENST00000529544 KIF27Q86VH2 1401 aa21.58■■□□□ 1.05
BRMS1-206ENST00000529544 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
BRMS1-206ENST00000529544 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.52■■□□□ 1.04
BRMS1-206ENST00000529544 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.52■■□□□ 1.04
BRMS1-206ENST00000529544 CHD1O14646 1710 aa21.49■■□□□ 1.03
BRMS1-206ENST00000529544 FBLN2P98095 1184 aa21.45■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 SYNJ2O15056 1496 aa21.44■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 ADAMTS12P58397 1594 aa21.43■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 CUL7Q14999 1698 aa21.43■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.4■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.4■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 IGF1RP08069 1367 aa21.4■■□□□ 1.02
BRMS1-206ENST00000529544 OSCARQ8IYS5 282 aa21.38■■□□□ 1.01
BRMS1-206ENST00000529544 EEA1Q15075 1411 aa21.36■■□□□ 1.01
BRMS1-206ENST00000529544 GRIN2AQ12879 1464 aa21.32■■□□□ 1
BRMS1-206ENST00000529544 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.32■■□□□ 1
BRMS1-206ENST00000529544 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.28■■□□□ 1
BRMS1-206ENST00000529544 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
BRMS1-206ENST00000529544 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.24■□□□□ 0.99
BRMS1-206ENST00000529544 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.21■□□□□ 0.99
BRMS1-206ENST00000529544 CEP170Q5SW79 1584 aa21.2■□□□□ 0.98
BRMS1-206ENST00000529544 NUP160Q12769 1436 aa21.19■□□□□ 0.98
BRMS1-206ENST00000529544 PRXQ9BXM0 1461 aa21.19■□□□□ 0.98
BRMS1-206ENST00000529544 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.17■□□□□ 0.98
BRMS1-206ENST00000529544 KIF21BO75037 1637 aa21.11■□□□□ 0.97
BRMS1-206ENST00000529544 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.11■□□□□ 0.97
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