RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565982.1

TM6SF1-208, Transcript of transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

TSL 3

Gene TM6SF1, Length 856 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1-208ENST00000565982 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.57■■■■■ 7.77
TM6SF1-208ENST00000565982 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56■■■■■ 6.55
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCC9O60706 1549 aa53.63■■■■■ 6.18
TM6SF1-208ENST00000565982 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.19■■■■■ 6.1
TM6SF1-208ENST00000565982 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.72■■■■■ 6.03
TM6SF1-208ENST00000565982 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.67■■■■■ 6.02
TM6SF1-208ENST00000565982 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.55■■■■■ 6
TM6SF1-208ENST00000565982 NACADO15069 1562 aa52.43■■■■■ 5.98
TM6SF1-208ENST00000565982 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.19■■■■■ 5.95
TM6SF1-208ENST00000565982 SCRIBQ14160 1630 aa51.12■■■■■ 5.77
TM6SF1-208ENST00000565982 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.84■■■■■ 5.73
TM6SF1-208ENST00000565982 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.79■■■■■ 5.72
TM6SF1-208ENST00000565982 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.44■■■■■ 5.67
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TM6SF1-208ENST00000565982 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.31■■■■■ 5.48
TM6SF1-208ENST00000565982 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
TM6SF1-208ENST00000565982 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
TM6SF1-208ENST00000565982 SMARCA4P51532 1647 aa49.04■■■■■ 5.44
TM6SF1-208ENST00000565982 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.95■■■■■ 5.43
TM6SF1-208ENST00000565982 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.87■■■■■ 5.41
TM6SF1-208ENST00000565982 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.6■■■■■ 5.37
TM6SF1-208ENST00000565982 SMARCA2P51531 1590 aa48.58■■■■■ 5.37
TM6SF1-208ENST00000565982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.56■■■■■ 5.36
TM6SF1-208ENST00000565982 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.52■■■■■ 5.36
TM6SF1-208ENST00000565982 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
TM6SF1-208ENST00000565982 WIZO95785 1651 aa48.44■■■■■ 5.35
TM6SF1-208ENST00000565982 NCAPD3P42695 1498 aa48.37■■■■■ 5.33
TM6SF1-208ENST00000565982 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
TM6SF1-208ENST00000565982 HMGXB3Q12766 1538 aa48.22■■■■■ 5.31
TM6SF1-208ENST00000565982 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.11■■■■■ 5.29
TM6SF1-208ENST00000565982 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
TM6SF1-208ENST00000565982 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.52■■■■■ 5.2
TM6SF1-208ENST00000565982 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.03■■■■■ 5.12
TM6SF1-208ENST00000565982 CFTRP13569 1480 aa46.97■■■■■ 5.11
TM6SF1-208ENST00000565982 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.9■■■■■ 5.1
TM6SF1-208ENST00000565982 NESP48681 1621 aa46.71■■■■■ 5.07
TM6SF1-208ENST00000565982 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.61■■■■■ 5.05
TM6SF1-208ENST00000565982 PRDM2Q13029 1718 aa46.59■■■■■ 5.05
TM6SF1-208ENST00000565982 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.45■■■■■ 5.03
TM6SF1-208ENST00000565982 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.31■■■■■ 5
TM6SF1-208ENST00000565982 ERCC6Q03468 1493 aa46.23■■■■■ 4.99
TM6SF1-208ENST00000565982 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.16■■■■■ 4.98
TM6SF1-208ENST00000565982 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.09■■■■■ 4.97
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCC8Q09428 1581 aa46.05■■■■■ 4.96
TM6SF1-208ENST00000565982 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.99■■■■■ 4.95
TM6SF1-208ENST00000565982 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.97■■■■■ 4.95
TM6SF1-208ENST00000565982 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.88■■■■■ 4.93
TM6SF1-208ENST00000565982 CUX1P39880 1505 aa45.87■■■■■ 4.93
TM6SF1-208ENST00000565982 TRIM41Q8WV44 630 aa45.85■■■■■ 4.93
TM6SF1-208ENST00000565982 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
TM6SF1-208ENST00000565982 TOPBP1Q92547 1522 aa45.82■■■■■ 4.92
TM6SF1-208ENST00000565982 TOP2BQ02880 1626 aa45.81■■■■■ 4.92
TM6SF1-208ENST00000565982 SYNJ1O43426 1573 aa45.79■■■■■ 4.92
TM6SF1-208ENST00000565982 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.77■■■■■ 4.92
TM6SF1-208ENST00000565982 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
TM6SF1-208ENST00000565982 WDR62O43379 1518 aa45.76■■■■■ 4.92
TM6SF1-208ENST00000565982 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.55■■■■■ 4.88
TM6SF1-208ENST00000565982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
TM6SF1-208ENST00000565982 SOGA1O94964 1423 aa45.4■■■■■ 4.86
TM6SF1-208ENST00000565982 CUX2O14529 1486 aa45.34■■■■■ 4.85
TM6SF1-208ENST00000565982 IFT140Q96RY7 1462 aa45.3■■■■■ 4.84
TM6SF1-208ENST00000565982 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.24■■■■■ 4.83
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.21■■■■■ 4.83
TM6SF1-208ENST00000565982 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
TM6SF1-208ENST00000565982 KIF27Q86VH2 1401 aa45.09■■■■■ 4.81
TM6SF1-208ENST00000565982 EEA1Q15075 1411 aa45.06■■■■■ 4.8
TM6SF1-208ENST00000565982 WDR97A6NE52 1622 aa45.04■■■■■ 4.8
TM6SF1-208ENST00000565982 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.79
TM6SF1-208ENST00000565982 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.88■■■■■ 4.78
TM6SF1-208ENST00000565982 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.86■■■■■ 4.77
TM6SF1-208ENST00000565982 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.84■■■■■ 4.77
TM6SF1-208ENST00000565982 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.81■■■■■ 4.76
TM6SF1-208ENST00000565982 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
TM6SF1-208ENST00000565982 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
TM6SF1-208ENST00000565982 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.76■■■■■ 4.76
TM6SF1-208ENST00000565982 GRIN2BQ13224 1484 aa44.73■■■■■ 4.75
TM6SF1-208ENST00000565982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.72■■■■■ 4.75
TM6SF1-208ENST00000565982 IGF1RP08069 1367 aa44.69■■■■■ 4.75
TM6SF1-208ENST00000565982 PBRM1Q86U86 1689 aa44.59■■■■■ 4.73
TM6SF1-208ENST00000565982 CUL7Q14999 1698 aa44.51■■■■■ 4.72
TM6SF1-208ENST00000565982 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
TM6SF1-208ENST00000565982 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.49■■■■■ 4.71
TM6SF1-208ENST00000565982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.45■■■■■ 4.71
TM6SF1-208ENST00000565982 PRXQ9BXM0 1461 aa44.45■■■■■ 4.71
TM6SF1-208ENST00000565982 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.43■■■■■ 4.7
TM6SF1-208ENST00000565982 KIF21BO75037 1637 aa44.36■■■■■ 4.69
TM6SF1-208ENST00000565982 ADAMTS12P58397 1594 aa44.36■■■■■ 4.69
TM6SF1-208ENST00000565982 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.35■■■■■ 4.69
TM6SF1-208ENST00000565982 SYNJ2O15056 1496 aa44.29■■■■■ 4.68
TM6SF1-208ENST00000565982 GOLGA3Q08378 1498 aa44.25■■■■■ 4.67
TM6SF1-208ENST00000565982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
TM6SF1-208ENST00000565982 GRIN2AQ12879 1464 aa44.13■■■■■ 4.65
TM6SF1-208ENST00000565982 FBLN2P98095 1184 aa44.12■■■■■ 4.65
TM6SF1-208ENST00000565982 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
TM6SF1-208ENST00000565982 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.03■■■■■ 4.64
TM6SF1-208ENST00000565982 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.02■■■■■ 4.64
TM6SF1-208ENST00000565982 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.92■■■■■ 4.62
TM6SF1-208ENST00000565982 CHD1O14646 1710 aa43.92■■■■■ 4.62
TM6SF1-208ENST00000565982 NUP160Q12769 1436 aa43.89■■■■■ 4.62
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