Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTAO43765 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTAO43765 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGTAO43765 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTAO43765 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTAO43765 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGTAO43765 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTAO43765 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTAO43765 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTAO43765 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms