Protein–RNA interactions for Protein: K7EMI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
K7EMI3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
K7EMI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
K7EMI3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
K7EMI3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
K7EMI3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
K7EMI3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
K7EMI3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
K7EMI3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
K7EMI3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
K7EMI3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
K7EMI3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
K7EMI3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
K7EMI3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
K7EMI3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
K7EMI3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
K7EMI3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms