Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMPRSS4Q9NRS4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms