RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349959.3

PKIG-201, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKIG, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIG-201ENST00000349959 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
PKIG-201ENST00000349959 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.64■■■□□ 2.82
PKIG-201ENST00000349959 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.18■■■□□ 2.74
PKIG-201ENST00000349959 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PKIG-201ENST00000349959 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PKIG-201ENST00000349959 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.14■■■□□ 2.1
PKIG-201ENST00000349959 FOXD1Q16676 465 aa27.39■■□□□ 1.98
PKIG-201ENST00000349959 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PKIG-201ENST00000349959 ABCC9O60706 1549 aa26.75■■□□□ 1.87
PKIG-201ENST00000349959 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.67■■□□□ 1.86
PKIG-201ENST00000349959 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.55■■□□□ 1.84
PKIG-201ENST00000349959 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.38■■□□□ 1.81
PKIG-201ENST00000349959 NACADO15069 1562 aa26.21■■□□□ 1.79
PKIG-201ENST00000349959 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.16■■□□□ 1.78
PKIG-201ENST00000349959 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.01■■□□□ 1.75
PKIG-201ENST00000349959 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.99■■□□□ 1.75
PKIG-201ENST00000349959 SCRIBQ14160 1630 aa25.79■■□□□ 1.72
PKIG-201ENST00000349959 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.74■■□□□ 1.71
PKIG-201ENST00000349959 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.7■■□□□ 1.7
PKIG-201ENST00000349959 ADRA2BP18089 450 aa25.58■■□□□ 1.69
PKIG-201ENST00000349959 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PKIG-201ENST00000349959 MSH5O43196 834 aa25.47■■□□□ 1.67
PKIG-201ENST00000349959 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.36■■□□□ 1.65
PKIG-201ENST00000349959 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PKIG-201ENST00000349959 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.08■■□□□ 1.61
PKIG-201ENST00000349959 POTEDQ86YR6 584 aa25.01■■□□□ 1.59
PKIG-201ENST00000349959 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
PKIG-201ENST00000349959 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PKIG-201ENST00000349959 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.92■■□□□ 1.58
PKIG-201ENST00000349959 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PKIG-201ENST00000349959 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.81■■□□□ 1.56
PKIG-201ENST00000349959 SMARCA4P51532 1647 aa24.75■■□□□ 1.55
PKIG-201ENST00000349959 WIZO95785 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
PKIG-201ENST00000349959 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.46■■□□□ 1.51
PKIG-201ENST00000349959 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PKIG-201ENST00000349959 SMARCA2P51531 1590 aa24.38■■□□□ 1.49
PKIG-201ENST00000349959 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PKIG-201ENST00000349959 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
PKIG-201ENST00000349959 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PKIG-201ENST00000349959 HMGXB3Q12766 1538 aa24.15■■□□□ 1.46
PKIG-201ENST00000349959 NCAPD3P42695 1498 aa24.14■■□□□ 1.46
PKIG-201ENST00000349959 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.13■■□□□ 1.45
PKIG-201ENST00000349959 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.12■■□□□ 1.45
PKIG-201ENST00000349959 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.99■■□□□ 1.43
PKIG-201ENST00000349959 TRIM41Q8WV44 630 aa23.76■■□□□ 1.39
PKIG-201ENST00000349959 CFTRP13569 1480 aa23.6■■□□□ 1.37
PKIG-201ENST00000349959 ABCC8Q09428 1581 aa23.58■■□□□ 1.37
PKIG-201ENST00000349959 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PKIG-201ENST00000349959 PRDM2Q13029 1718 aa23.53■■□□□ 1.36
PKIG-201ENST00000349959 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.52■■□□□ 1.36
PKIG-201ENST00000349959 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
PKIG-201ENST00000349959 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.37■■□□□ 1.33
PKIG-201ENST00000349959 SYNJ1O43426 1573 aa23.36■■□□□ 1.33
PKIG-201ENST00000349959 TOP2BQ02880 1626 aa23.33■■□□□ 1.32
PKIG-201ENST00000349959 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
PKIG-201ENST00000349959 CUX2O14529 1486 aa23.27■■□□□ 1.32
PKIG-201ENST00000349959 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.26■■□□□ 1.31
PKIG-201ENST00000349959 EEA1Q15075 1411 aa23.25■■□□□ 1.31
PKIG-201ENST00000349959 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PKIG-201ENST00000349959 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.23■■□□□ 1.31
PKIG-201ENST00000349959 NESP48681 1621 aa23.22■■□□□ 1.31
PKIG-201ENST00000349959 CUX1P39880 1505 aa23.22■■□□□ 1.31
PKIG-201ENST00000349959 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.19■■□□□ 1.3
PKIG-201ENST00000349959 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PKIG-201ENST00000349959 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.15■■□□□ 1.3
PKIG-201ENST00000349959 SOGA1O94964 1423 aa23.14■■□□□ 1.29
PKIG-201ENST00000349959 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.13■■□□□ 1.29
PKIG-201ENST00000349959 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.08■■□□□ 1.29
PKIG-201ENST00000349959 ERCC6Q03468 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
PKIG-201ENST00000349959 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.04■■□□□ 1.28
PKIG-201ENST00000349959 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.01■■□□□ 1.27
PKIG-201ENST00000349959 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23■■□□□ 1.27
PKIG-201ENST00000349959 TOPBP1Q92547 1522 aa23■■□□□ 1.27
PKIG-201ENST00000349959 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.99■■□□□ 1.27
PKIG-201ENST00000349959 KIF27Q86VH2 1401 aa22.96■■□□□ 1.27
PKIG-201ENST00000349959 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PKIG-201ENST00000349959 KIF21BO75037 1637 aa22.9■■□□□ 1.26
PKIG-201ENST00000349959 GOLGA3Q08378 1498 aa22.89■■□□□ 1.25
PKIG-201ENST00000349959 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.88■■□□□ 1.25
PKIG-201ENST00000349959 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PKIG-201ENST00000349959 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.87■■□□□ 1.25
PKIG-201ENST00000349959 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.86■■□□□ 1.25
PKIG-201ENST00000349959 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.81■■□□□ 1.24
PKIG-201ENST00000349959 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.79■■□□□ 1.24
PKIG-201ENST00000349959 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PKIG-201ENST00000349959 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.76■■□□□ 1.23
PKIG-201ENST00000349959 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.76■■□□□ 1.23
PKIG-201ENST00000349959 PRXQ9BXM0 1461 aa22.74■■□□□ 1.23
PKIG-201ENST00000349959 WDR62O43379 1518 aa22.74■■□□□ 1.23
PKIG-201ENST00000349959 WDR97A6NE52 1622 aa22.72■■□□□ 1.23
PKIG-201ENST00000349959 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.69■■□□□ 1.22
PKIG-201ENST00000349959 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PKIG-201ENST00000349959 IGF1RP08069 1367 aa22.67■■□□□ 1.22
PKIG-201ENST00000349959 CEP162Q5TB80 1403 aa22.64■■□□□ 1.21
PKIG-201ENST00000349959 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PKIG-201ENST00000349959 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.61■■□□□ 1.21
PKIG-201ENST00000349959 IFT140Q96RY7 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
PKIG-201ENST00000349959 CUL7Q14999 1698 aa22.6■■□□□ 1.21
PKIG-201ENST00000349959 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.6■■□□□ 1.21
PKIG-201ENST00000349959 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.58■■□□□ 1.2
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