Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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