RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554071.1

FOXN3-AS2-201, FOXN3 antisense RNA 2, humanhuman

BASIC

Gene FOXN3-AS2, Length 1,262 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.48■■■□□ 2.95
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.85■■■□□ 2.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ABCC9O60706 1549 aa29.28■■■□□ 2.28
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.16■■■□□ 2.1
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 NACADO15069 1562 aa28.11■■■□□ 2.09
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.97■■■□□ 2.07
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.89■■■□□ 2.06
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.77■■■□□ 2.04
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.47■■□□□ 1.99
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SCRIBQ14160 1630 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.11■■□□□ 1.93
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.08■■□□□ 1.93
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.92■■□□□ 1.9
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.51■■□□□ 1.83
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.36■■□□□ 1.81
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SMARCA4P51532 1647 aa25.99■■□□□ 1.75
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 NCAPD3P42695 1498 aa25.97■■□□□ 1.75
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.92■■□□□ 1.74
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SMARCA2P51531 1590 aa25.88■■□□□ 1.73
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.82■■□□□ 1.72
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 HMGXB3Q12766 1538 aa25.8■■□□□ 1.72
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.76■■□□□ 1.71
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 WIZO95785 1651 aa25.44■■□□□ 1.66
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 NESP48681 1621 aa25.3■■□□□ 1.64
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.27■■□□□ 1.64
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ERCC6Q03468 1493 aa25.25■■□□□ 1.63
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.18■■□□□ 1.62
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CUX2O14529 1486 aa25.14■■□□□ 1.61
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CFTRP13569 1480 aa25■■□□□ 1.59
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.98■■□□□ 1.59
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.91■■□□□ 1.58
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.85■■□□□ 1.57
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.84■■□□□ 1.57
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.83■■□□□ 1.56
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 WDR62O43379 1518 aa24.78■■□□□ 1.56
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 PRDM2Q13029 1718 aa24.74■■□□□ 1.55
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.56■■□□□ 1.52
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ABCC8Q09428 1581 aa24.48■■□□□ 1.51
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 TOPBP1Q92547 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.4■■□□□ 1.5
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 IFT140Q96RY7 1462 aa24.34■■□□□ 1.49
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CUX1P39880 1505 aa24.18■■□□□ 1.46
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.12■■□□□ 1.45
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SOGA1O94964 1423 aa24.11■■□□□ 1.45
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.08■■□□□ 1.45
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 WDR97A6NE52 1622 aa24.05■■□□□ 1.44
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 OSCARQ8IYS5 282 aa24.03■■□□□ 1.44
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 TOP2BQ02880 1626 aa23.95■■□□□ 1.42
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.94■■□□□ 1.42
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.92■■□□□ 1.42
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SYNJ1O43426 1573 aa23.9■■□□□ 1.42
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 GRIN2BQ13224 1484 aa23.87■■□□□ 1.41
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.83■■□□□ 1.41
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.82■■□□□ 1.4
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CHD1O14646 1710 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 PBRM1Q86U86 1689 aa23.75■■□□□ 1.39
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 SYNJ2O15056 1496 aa23.74■■□□□ 1.39
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 FBLN2P98095 1184 aa23.73■■□□□ 1.39
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.64■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ARHGEF11O15085 1522 aa23.63■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.62■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.62■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.62■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.61■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ADAMTS12P58397 1594 aa23.59■■□□□ 1.37
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.57■■□□□ 1.36
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 GRIN2AQ12879 1464 aa23.55■■□□□ 1.36
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 TRIM41Q8WV44 630 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 NUP160Q12769 1436 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 KIF27Q86VH2 1401 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 IGF1RP08069 1367 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 ARAP1Q96P48 1450 aa23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CEP170Q5SW79 1584 aa23.42■■□□□ 1.34
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.38■■□□□ 1.33
FOXN3-AS2-201ENST00000554071 CUL7Q14999 1698 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.7 ms