Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.793e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.793e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-208ENST00000539595 1809 ntTSL 519.45■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-206ENST00000537907 602 ntTSL 318.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-205ENST00000536234 1748 ntTSL 317.15■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 346.3
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-205ENST00000430295 440 ntTSL 223.03■■□□□ 1.286e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 HERC3-205ENST00000426683 559 ntTSL 419.28■□□□□ 0.682e-10■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 HERC3-211ENST00000513325 582 ntTSL 517.91■□□□□ 0.462e-10■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.366e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.36e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 HERC3-206ENST00000431413 761 ntTSL 516.02■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.166e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 INPP5D-202ENST00000415617 3628 ntTSL 512.31□□□□□ -0.446e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 HERC3-204ENST00000422770 579 ntTSL 410.4□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 39.93□□□□□ -0.826e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 39.23□□□□□ -0.936e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-206ENST00000438202 652 ntTSL 28.99□□□□□ -0.976e-23■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-216ENST00000521918 558 ntTSL 47.37□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 346.1
UTP3Q9NQZ2 DLG5-203ENST00000459739 3167 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 345.9
UTP3Q9NQZ2 DLG5-202ENST00000424842 4292 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 345.9
UTP3Q9NQZ2 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 345.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF783-203ENST00000476295 2346 ntTSL 219.45■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 345.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF783-204ENST00000481519 1929 ntTSL 217.6■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 345.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF783-201ENST00000378052 2876 ntTSL 215.65■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 345.5
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 345.3
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 345.3
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1B-207ENST00000478500 3335 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 345.3
UTP3Q9NQZ2 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 217.24■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 344.9
UTP3Q9NQZ2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 344.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.838e-16■■■■■ 344.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.48e-16■■■■■ 344.7
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-214ENST00000556704 1299 ntTSL 514.14□□□□□ -0.152e-17■■■■■ 344.7
UTP3Q9NQZ2 AL022722.1-201ENST00000406333 582 ntBASIC12.21□□□□□ -0.451e-23■■■■■ 344.4
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-210ENST00000555652 379 ntTSL 324.77■■□□□ 1.566e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-212ENST00000555989 569 ntTSL 420.72■□□□□ 0.916e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-204ENST00000553453 521 ntTSL 520.56■□□□□ 0.886e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-214ENST00000556780 591 ntTSL 519.82■□□□□ 0.766e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-216ENST00000557151 744 ntTSL 317.46■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-213ENST00000556408 903 ntTSL 39.99□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-206ENST00000554362 552 ntTSL 55.36□□□□□ -1.556e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L1-205ENST00000554126 576 ntTSL 54.05□□□□□ -1.766e-10■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.485e-17■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-17■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.225e-17■■■■■ 344.2
UTP3Q9NQZ2 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 343.9
UTP3Q9NQZ2 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 215.17■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 343.5
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-204ENST00000524713 1591 ntTSL 523.39■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 343
UTP3Q9NQZ2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 343
UTP3Q9NQZ2 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 343
UTP3Q9NQZ2 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 343
UTP3Q9NQZ2 PIK3CG-204ENST00000473541 821 ntTSL 58.57□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 343
UTP3Q9NQZ2 DLG5-204ENST00000463362 2927 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 342.9
UTP3Q9NQZ2 KSR1-211ENST00000580163 479 ntTSL 323.48■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 342.4
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 516.88■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 342.3
UTP3Q9NQZ2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-20■■■■■ 342.2
UTP3Q9NQZ2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-20■■■■■ 342.2
UTP3Q9NQZ2 TRIM41-204ENST00000508930 3834 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.051e-20■■■■■ 342.2
UTP3Q9NQZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.612e-17■■■■■ 341.9
UTP3Q9NQZ2 RFC2-207ENST00000480432 871 ntTSL 320.65■□□□□ 0.92e-17■■■■■ 341.9
UTP3Q9NQZ2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.882e-17■■■■■ 341.9
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF8-205ENST00000514649 2412 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 341.7
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 341.7
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 341.7
UTP3Q9NQZ2 NAA35-203ENST00000416045 690 ntTSL 321.44■■□□□ 1.021e-16■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 TWNK-205ENST00000476766 838 ntTSL 315.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-16■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 TWNK-204ENST00000473656 946 ntTSL 212.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.771e-16■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 TWNK-203ENST00000459764 327 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 LAPTM4A-202ENST00000483117 487 ntTSL 26.74□□□□□ -1.332e-32■■■■■ 341.6
UTP3Q9NQZ2 STON2-203ENST00000554710 439 ntTSL 423.1■■□□□ 1.298e-7■■■■■ 341.5
UTP3Q9NQZ2 STON2-208ENST00000557055 603 ntTSL 517.45■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 341.5
UTP3Q9NQZ2 PSMA5-203ENST00000484563 1503 ntTSL 217.45■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 341
UTP3Q9NQZ2 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 341
UTP3Q9NQZ2 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 341
UTP3Q9NQZ2 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 341
UTP3Q9NQZ2 ATP13A1-204ENST00000467160 2431 ntTSL 219.61■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 340.8
UTP3Q9NQZ2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 340.8
UTP3Q9NQZ2 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 37.36□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 340.8
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 340.3
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 340.3
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 340.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 421.74■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 338.9
UTP3Q9NQZ2 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 515.91■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 338.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-8■■■■■ 338.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 338.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 338.5
UTP3Q9NQZ2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 338.4
UTP3Q9NQZ2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 338.4
UTP3Q9NQZ2 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 338.4
UTP3Q9NQZ2 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 338.2
UTP3Q9NQZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-13■■■■■ 337.8
UTP3Q9NQZ2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-13■■■■■ 337.8
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-210ENST00000572473 575 ntTSL 522.14■■□□□ 1.132e-17■■■■■ 337.7
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-209ENST00000572157 442 ntTSL 412.28□□□□□ -0.442e-17■■■■■ 337.7
UTP3Q9NQZ2 GTPBP1-203ENST00000458073 1350 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 337.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP1-206ENST00000462332 3035 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 337.1
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