RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.49■■■■□ 3.59
HERC3-206ENST00000431413 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.53■■■□□ 2.96
HERC3-206ENST00000431413 ABCC9O60706 1549 aa33.37■■■□□ 2.93
HERC3-206ENST00000431413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.88■■■□□ 2.69
HERC3-206ENST00000431413 NACADO15069 1562 aa31.71■■■□□ 2.67
HERC3-206ENST00000431413 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.67■■■□□ 2.66
HERC3-206ENST00000431413 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.35■■■□□ 2.61
HERC3-206ENST00000431413 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.57
HERC3-206ENST00000431413 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.09■■■□□ 2.57
HERC3-206ENST00000431413 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.01■■■□□ 2.55
HERC3-206ENST00000431413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31■■■□□ 2.55
HERC3-206ENST00000431413 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.84■■■□□ 2.53
HERC3-206ENST00000431413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.58■■■□□ 2.49
HERC3-206ENST00000431413 SCRIBQ14160 1630 aa30.55■■■□□ 2.48
HERC3-206ENST00000431413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
HERC3-206ENST00000431413 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.13■■■□□ 2.41
HERC3-206ENST00000431413 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.06■■■□□ 2.4
HERC3-206ENST00000431413 NCAPD3P42695 1498 aa29.28■■■□□ 2.28
HERC3-206ENST00000431413 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.19■■■□□ 2.26
HERC3-206ENST00000431413 SMARCA4P51532 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
HERC3-206ENST00000431413 SMARCA2P51531 1590 aa29.15■■■□□ 2.26
HERC3-206ENST00000431413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HERC3-206ENST00000431413 HMGXB3Q12766 1538 aa29.06■■■□□ 2.24
HERC3-206ENST00000431413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HERC3-206ENST00000431413 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.91■■■□□ 2.22
HERC3-206ENST00000431413 ERCC6Q03468 1493 aa28.86■■■□□ 2.21
HERC3-206ENST00000431413 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.86■■■□□ 2.21
HERC3-206ENST00000431413 CUX2O14529 1486 aa28.72■■■□□ 2.19
HERC3-206ENST00000431413 NESP48681 1621 aa28.69■■■□□ 2.18
HERC3-206ENST00000431413 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.5■■■□□ 2.15
HERC3-206ENST00000431413 WIZO95785 1651 aa28.49■■■□□ 2.15
HERC3-206ENST00000431413 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.46■■■□□ 2.15
HERC3-206ENST00000431413 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.42■■■□□ 2.14
HERC3-206ENST00000431413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HERC3-206ENST00000431413 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HERC3-206ENST00000431413 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.29■■■□□ 2.12
HERC3-206ENST00000431413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HERC3-206ENST00000431413 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.15■■■□□ 2.1
HERC3-206ENST00000431413 CFTRP13569 1480 aa28.1■■■□□ 2.09
HERC3-206ENST00000431413 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.09■■■□□ 2.09
HERC3-206ENST00000431413 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.07■■■□□ 2.08
HERC3-206ENST00000431413 WDR62O43379 1518 aa28.04■■■□□ 2.08
HERC3-206ENST00000431413 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.89■■■□□ 2.05
HERC3-206ENST00000431413 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HERC3-206ENST00000431413 PRDM2Q13029 1718 aa27.75■■■□□ 2.03
HERC3-206ENST00000431413 ABCC8Q09428 1581 aa27.58■■■□□ 2.01
HERC3-206ENST00000431413 TOPBP1Q92547 1522 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-206ENST00000431413 IFT140Q96RY7 1462 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-206ENST00000431413 OSCARQ8IYS5 282 aa27.51■■□□□ 1.99
HERC3-206ENST00000431413 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.46■■□□□ 1.99
HERC3-206ENST00000431413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HERC3-206ENST00000431413 TRIM41Q8WV44 630 aa27.34■■□□□ 1.97
HERC3-206ENST00000431413 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HERC3-206ENST00000431413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
HERC3-206ENST00000431413 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
HERC3-206ENST00000431413 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
HERC3-206ENST00000431413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
HERC3-206ENST00000431413 SOGA1O94964 1423 aa27.2■■□□□ 1.94
HERC3-206ENST00000431413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.15■■□□□ 1.94
HERC3-206ENST00000431413 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.13■■□□□ 1.93
HERC3-206ENST00000431413 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HERC3-206ENST00000431413 CUX1P39880 1505 aa27.1■■□□□ 1.93
HERC3-206ENST00000431413 FBLN2P98095 1184 aa27.09■■□□□ 1.93
HERC3-206ENST00000431413 WDR97A6NE52 1622 aa27.05■■□□□ 1.92
HERC3-206ENST00000431413 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.99■■□□□ 1.91
HERC3-206ENST00000431413 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.99■■□□□ 1.91
HERC3-206ENST00000431413 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.99■■□□□ 1.91
HERC3-206ENST00000431413 CHD1O14646 1710 aa26.99■■□□□ 1.91
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF11O15085 1522 aa26.96■■□□□ 1.91
HERC3-206ENST00000431413 GRIN2BQ13224 1484 aa26.93■■□□□ 1.9
HERC3-206ENST00000431413 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.93■■□□□ 1.9
HERC3-206ENST00000431413 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HERC3-206ENST00000431413 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HERC3-206ENST00000431413 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.86■■□□□ 1.89
HERC3-206ENST00000431413 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.85■■□□□ 1.89
HERC3-206ENST00000431413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
HERC3-206ENST00000431413 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.82■■□□□ 1.88
HERC3-206ENST00000431413 SYNJ2O15056 1496 aa26.81■■□□□ 1.88
HERC3-206ENST00000431413 SYNJ1O43426 1573 aa26.78■■□□□ 1.88
HERC3-206ENST00000431413 PBRM1Q86U86 1689 aa26.74■■□□□ 1.87
HERC3-206ENST00000431413 TOP2BQ02880 1626 aa26.74■■□□□ 1.87
HERC3-206ENST00000431413 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.73■■□□□ 1.87
HERC3-206ENST00000431413 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.72■■□□□ 1.87
HERC3-206ENST00000431413 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.71■■□□□ 1.87
HERC3-206ENST00000431413 ARAP1Q96P48 1450 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-206ENST00000431413 GRIN2AQ12879 1464 aa26.56■■□□□ 1.84
HERC3-206ENST00000431413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.55■■□□□ 1.84
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTS12P58397 1594 aa26.53■■□□□ 1.84
HERC3-206ENST00000431413 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.52■■□□□ 1.84
HERC3-206ENST00000431413 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HERC3-206ENST00000431413 NUP160Q12769 1436 aa26.46■■□□□ 1.83
HERC3-206ENST00000431413 CEP170Q5SW79 1584 aa26.41■■□□□ 1.82
HERC3-206ENST00000431413 KIF27Q86VH2 1401 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC3-206ENST00000431413 SHROOM2Q13796 1616 aa26.28■■□□□ 1.8
HERC3-206ENST00000431413 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.27■■□□□ 1.8
HERC3-206ENST00000431413 JPH4Q96JJ6 628 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC3-206ENST00000431413 IGF1RP08069 1367 aa26.23■■□□□ 1.79
HERC3-206ENST00000431413 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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