RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555652.5

SIPA1L1-210, Transcript of signal induced proliferation associated 1 like 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIPA1L1, Length 379 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1-210ENST00000555652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58■■■■■ 6.88
SIPA1L1-210ENST00000555652 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.82■■■■■ 5.89
SIPA1L1-210ENST00000555652 ABCC9O60706 1549 aa51.13■■■■■ 5.77
SIPA1L1-210ENST00000555652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.05■■■■■ 5.44
SIPA1L1-210ENST00000555652 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
SIPA1L1-210ENST00000555652 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
SIPA1L1-210ENST00000555652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.51■■■■■ 5.36
SIPA1L1-210ENST00000555652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
SIPA1L1-210ENST00000555652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.07■■■■■ 5.29
SIPA1L1-210ENST00000555652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.86■■■■■ 5.25
SIPA1L1-210ENST00000555652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.68■■■■■ 5.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.58■■■■■ 5.21
SIPA1L1-210ENST00000555652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.54■■■■■ 5.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.16■■■■■ 5.14
SIPA1L1-210ENST00000555652 SCRIBQ14160 1630 aa47.07■■■■■ 5.13
SIPA1L1-210ENST00000555652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
SIPA1L1-210ENST00000555652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.28■■■■■ 5
SIPA1L1-210ENST00000555652 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.07■■■■■ 4.97
SIPA1L1-210ENST00000555652 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
SIPA1L1-210ENST00000555652 SMARCA4P51532 1647 aa45.08■■■■■ 4.81
SIPA1L1-210ENST00000555652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.03■■■■■ 4.8
SIPA1L1-210ENST00000555652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
SIPA1L1-210ENST00000555652 SMARCA2P51531 1590 aa44.95■■■■■ 4.79
SIPA1L1-210ENST00000555652 HMGXB3Q12766 1538 aa44.84■■■■■ 4.77
SIPA1L1-210ENST00000555652 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.77■■■■■ 4.76
SIPA1L1-210ENST00000555652 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.62■■■■■ 4.73
SIPA1L1-210ENST00000555652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
SIPA1L1-210ENST00000555652 ERCC6Q03468 1493 aa44.12■■■■■ 4.65
SIPA1L1-210ENST00000555652 NESP48681 1621 aa44.08■■■■■ 4.65
SIPA1L1-210ENST00000555652 WIZO95785 1651 aa44.07■■■■■ 4.64
SIPA1L1-210ENST00000555652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.01■■■■■ 4.64
SIPA1L1-210ENST00000555652 CUX2O14529 1486 aa44.01■■■■■ 4.64
SIPA1L1-210ENST00000555652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
SIPA1L1-210ENST00000555652 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.77■■■■■ 4.6
SIPA1L1-210ENST00000555652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.73■■■■■ 4.59
SIPA1L1-210ENST00000555652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
SIPA1L1-210ENST00000555652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
SIPA1L1-210ENST00000555652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.54■■■■■ 4.56
SIPA1L1-210ENST00000555652 CFTRP13569 1480 aa43.4■■■■■ 4.54
SIPA1L1-210ENST00000555652 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.36■■■■■ 4.53
SIPA1L1-210ENST00000555652 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.27■■■■■ 4.52
SIPA1L1-210ENST00000555652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.2■■■■■ 4.51
SIPA1L1-210ENST00000555652 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.2■■■■■ 4.51
SIPA1L1-210ENST00000555652 WDR62O43379 1518 aa43.17■■■■■ 4.5
SIPA1L1-210ENST00000555652 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.13■■■■■ 4.49
SIPA1L1-210ENST00000555652 PRDM2Q13029 1718 aa42.94■■■■■ 4.47
SIPA1L1-210ENST00000555652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
SIPA1L1-210ENST00000555652 ABCC8Q09428 1581 aa42.52■■■■■ 4.4
SIPA1L1-210ENST00000555652 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
SIPA1L1-210ENST00000555652 IFT140Q96RY7 1462 aa42.36■■■■■ 4.37
SIPA1L1-210ENST00000555652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.35■■■■■ 4.37
SIPA1L1-210ENST00000555652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
SIPA1L1-210ENST00000555652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
SIPA1L1-210ENST00000555652 OSCARQ8IYS5 282 aa42.07■■■■■ 4.33
SIPA1L1-210ENST00000555652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
SIPA1L1-210ENST00000555652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
SIPA1L1-210ENST00000555652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
SIPA1L1-210ENST00000555652 CUX1P39880 1505 aa41.9■■■■■ 4.3
SIPA1L1-210ENST00000555652 SOGA1O94964 1423 aa41.89■■■■■ 4.3
SIPA1L1-210ENST00000555652 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
SIPA1L1-210ENST00000555652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.84■■■■■ 4.29
SIPA1L1-210ENST00000555652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.82■■■■■ 4.29
SIPA1L1-210ENST00000555652 WDR97A6NE52 1622 aa41.78■■■■■ 4.28
SIPA1L1-210ENST00000555652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
SIPA1L1-210ENST00000555652 CHD1O14646 1710 aa41.49■■■■■ 4.23
SIPA1L1-210ENST00000555652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.48■■■■■ 4.23
SIPA1L1-210ENST00000555652 GRIN2BQ13224 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
SIPA1L1-210ENST00000555652 TRIM41Q8WV44 630 aa41.46■■■■■ 4.23
SIPA1L1-210ENST00000555652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
SIPA1L1-210ENST00000555652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.42■■■■■ 4.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 TOP2BQ02880 1626 aa41.42■■■■■ 4.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.41■■■■■ 4.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 FBLN2P98095 1184 aa41.39■■■■■ 4.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.39■■■■■ 4.22
SIPA1L1-210ENST00000555652 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
SIPA1L1-210ENST00000555652 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
SIPA1L1-210ENST00000555652 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
SIPA1L1-210ENST00000555652 ARHGEF11O15085 1522 aa41.32■■■■■ 4.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.32■■■■■ 4.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 SYNJ1O43426 1573 aa41.3■■■■■ 4.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 SYNJ2O15056 1496 aa41.28■■■■■ 4.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 PBRM1Q86U86 1689 aa41.26■■■■■ 4.2
SIPA1L1-210ENST00000555652 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.13■■■■■ 4.18
SIPA1L1-210ENST00000555652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.98■■■■■ 4.15
SIPA1L1-210ENST00000555652 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.95■■■■■ 4.15
SIPA1L1-210ENST00000555652 ARAP1Q96P48 1450 aa40.94■■■■■ 4.14
SIPA1L1-210ENST00000555652 ADAMTS12P58397 1594 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1L1-210ENST00000555652 GRIN2AQ12879 1464 aa40.92■■■■■ 4.14
SIPA1L1-210ENST00000555652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.92■■■■■ 4.14
SIPA1L1-210ENST00000555652 NUP160Q12769 1436 aa40.82■■■■■ 4.12
SIPA1L1-210ENST00000555652 CEP170Q5SW79 1584 aa40.7■■■■■ 4.11
SIPA1L1-210ENST00000555652 KIF27Q86VH2 1401 aa40.63■■■■■ 4.09
SIPA1L1-210ENST00000555652 IGF1RP08069 1367 aa40.58■■■■■ 4.09
SIPA1L1-210ENST00000555652 SHROOM2Q13796 1616 aa40.56■■■■■ 4.08
SIPA1L1-210ENST00000555652 CUL7Q14999 1698 aa40.45■■■■■ 4.07
SIPA1L1-210ENST00000555652 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.43■■■■■ 4.06
SIPA1L1-210ENST00000555652 JPH4Q96JJ6 628 aa40.39■■■■■ 4.06
SIPA1L1-210ENST00000555652 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.34■■■■■ 4.05
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