RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.28■■■■■ 4.36
HERC3-211ENST00000513325 ABCC9O60706 1549 aa37.87■■■■□ 3.65
HERC3-211ENST00000513325 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.86■■■■□ 3.65
HERC3-211ENST00000513325 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.03■■■■□ 3.36
HERC3-211ENST00000513325 NACADO15069 1562 aa35.81■■■■□ 3.32
HERC3-211ENST00000513325 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.74■■■■□ 3.31
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.5■■■■□ 3.27
HERC3-211ENST00000513325 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.32■■■■□ 3.25
HERC3-211ENST00000513325 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
HERC3-211ENST00000513325 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.2■■■■□ 3.23
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
HERC3-211ENST00000513325 BICRAQ9NZM4 1560 aa35■■■■□ 3.19
HERC3-211ENST00000513325 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.9■■■■□ 3.18
HERC3-211ENST00000513325 SCRIBQ14160 1630 aa34.55■■■■□ 3.12
HERC3-211ENST00000513325 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.49■■■■□ 3.11
HERC3-211ENST00000513325 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.19■■■■□ 3.06
HERC3-211ENST00000513325 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
HERC3-211ENST00000513325 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.1■■■■□ 3.05
HERC3-211ENST00000513325 NCAPD3P42695 1498 aa33.07■■■□□ 2.88
HERC3-211ENST00000513325 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.99■■■□□ 2.87
HERC3-211ENST00000513325 SMARCA4P51532 1647 aa32.95■■■□□ 2.87
HERC3-211ENST00000513325 SMARCA2P51531 1590 aa32.88■■■□□ 2.85
HERC3-211ENST00000513325 HMGXB3Q12766 1538 aa32.81■■■□□ 2.84
HERC3-211ENST00000513325 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
HERC3-211ENST00000513325 ERCC6Q03468 1493 aa32.67■■■□□ 2.82
HERC3-211ENST00000513325 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
HERC3-211ENST00000513325 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.62■■■□□ 2.81
HERC3-211ENST00000513325 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.6■■■□□ 2.81
HERC3-211ENST00000513325 CUX2O14529 1486 aa32.56■■■□□ 2.8
HERC3-211ENST00000513325 NESP48681 1621 aa32.55■■■□□ 2.8
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.51■■■□□ 2.79
HERC3-211ENST00000513325 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.3■■■□□ 2.76
HERC3-211ENST00000513325 WIZO95785 1651 aa32.2■■■□□ 2.74
HERC3-211ENST00000513325 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
HERC3-211ENST00000513325 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.13■■■□□ 2.73
HERC3-211ENST00000513325 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.1■■■□□ 2.73
HERC3-211ENST00000513325 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.09■■■□□ 2.73
HERC3-211ENST00000513325 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
HERC3-211ENST00000513325 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.84■■■□□ 2.69
HERC3-211ENST00000513325 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
HERC3-211ENST00000513325 WDR62O43379 1518 aa31.75■■■□□ 2.67
HERC3-211ENST00000513325 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.73■■■□□ 2.67
HERC3-211ENST00000513325 CFTRP13569 1480 aa31.72■■■□□ 2.67
HERC3-211ENST00000513325 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.72■■■□□ 2.67
HERC3-211ENST00000513325 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.46■■■□□ 2.63
HERC3-211ENST00000513325 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
HERC3-211ENST00000513325 PRDM2Q13029 1718 aa31.35■■■□□ 2.61
HERC3-211ENST00000513325 TRIM41Q8WV44 630 aa31.16■■■□□ 2.58
HERC3-211ENST00000513325 OSCARQ8IYS5 282 aa31.15■■■□□ 2.58
HERC3-211ENST00000513325 TOPBP1Q92547 1522 aa31.13■■■□□ 2.57
HERC3-211ENST00000513325 IFT140Q96RY7 1462 aa31.09■■■□□ 2.57
HERC3-211ENST00000513325 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
HERC3-211ENST00000513325 ABCC8Q09428 1581 aa31.05■■■□□ 2.56
HERC3-211ENST00000513325 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31■■■□□ 2.55
HERC3-211ENST00000513325 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HERC3-211ENST00000513325 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
HERC3-211ENST00000513325 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.81■■■□□ 2.52
HERC3-211ENST00000513325 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HERC3-211ENST00000513325 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.72■■■□□ 2.51
HERC3-211ENST00000513325 SOGA1O94964 1423 aa30.69■■■□□ 2.5
HERC3-211ENST00000513325 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
HERC3-211ENST00000513325 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
HERC3-211ENST00000513325 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
HERC3-211ENST00000513325 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
HERC3-211ENST00000513325 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
HERC3-211ENST00000513325 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.63■■■□□ 2.49
HERC3-211ENST00000513325 FBLN2P98095 1184 aa30.62■■■□□ 2.49
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF11O15085 1522 aa30.62■■■□□ 2.49
HERC3-211ENST00000513325 CUX1P39880 1505 aa30.62■■■□□ 2.49
HERC3-211ENST00000513325 CHD1O14646 1710 aa30.61■■■□□ 2.49
HERC3-211ENST00000513325 WDR97A6NE52 1622 aa30.47■■■□□ 2.47
HERC3-211ENST00000513325 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.47■■■□□ 2.47
HERC3-211ENST00000513325 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.43■■■□□ 2.46
HERC3-211ENST00000513325 GRIN2BQ13224 1484 aa30.39■■■□□ 2.46
HERC3-211ENST00000513325 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HERC3-211ENST00000513325 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
HERC3-211ENST00000513325 ARAP1Q96P48 1450 aa30.31■■■□□ 2.44
HERC3-211ENST00000513325 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.31■■■□□ 2.44
HERC3-211ENST00000513325 SYNJ2O15056 1496 aa30.28■■■□□ 2.44
HERC3-211ENST00000513325 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.27■■■□□ 2.44
HERC3-211ENST00000513325 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.27■■■□□ 2.44
HERC3-211ENST00000513325 SYNJ1O43426 1573 aa30.26■■■□□ 2.43
HERC3-211ENST00000513325 PBRM1Q86U86 1689 aa30.24■■■□□ 2.43
HERC3-211ENST00000513325 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.21■■■□□ 2.43
HERC3-211ENST00000513325 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
HERC3-211ENST00000513325 TOP2BQ02880 1626 aa30.12■■■□□ 2.41
HERC3-211ENST00000513325 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.11■■■□□ 2.41
HERC3-211ENST00000513325 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
HERC3-211ENST00000513325 GRIN2AQ12879 1464 aa30■■■□□ 2.39
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS12P58397 1594 aa29.98■■■□□ 2.39
HERC3-211ENST00000513325 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.92■■■□□ 2.38
HERC3-211ENST00000513325 NUP160Q12769 1436 aa29.9■■■□□ 2.38
HERC3-211ENST00000513325 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.89■■■□□ 2.38
HERC3-211ENST00000513325 CEP170Q5SW79 1584 aa29.89■■■□□ 2.38
HERC3-211ENST00000513325 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.83■■■□□ 2.37
HERC3-211ENST00000513325 SHROOM2Q13796 1616 aa29.74■■■□□ 2.35
HERC3-211ENST00000513325 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
HERC3-211ENST00000513325 JPH4Q96JJ6 628 aa29.63■■■□□ 2.33
HERC3-211ENST00000513325 KIF27Q86VH2 1401 aa29.57■■■□□ 2.32
HERC3-211ENST00000513325 IGF1RP08069 1367 aa29.57■■■□□ 2.32
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