RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.75■■■■■ 4.59
HERC3-205ENST00000426683 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.85■■■■□ 3.81
HERC3-205ENST00000426683 ABCC9O60706 1549 aa38.12■■■■□ 3.69
HERC3-205ENST00000426683 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.64■■■■□ 3.46
HERC3-205ENST00000426683 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.61■■■■□ 3.45
HERC3-205ENST00000426683 NACADO15069 1562 aa36.57■■■■□ 3.44
HERC3-205ENST00000426683 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
HERC3-205ENST00000426683 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.33■■■■□ 3.41
HERC3-205ENST00000426683 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.17■■■■□ 3.38
HERC3-205ENST00000426683 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.71■■■■□ 3.31
HERC3-205ENST00000426683 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
HERC3-205ENST00000426683 SCRIBQ14160 1630 aa35.5■■■■□ 3.27
HERC3-205ENST00000426683 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.5■■■■□ 3.27
HERC3-205ENST00000426683 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.11■■■■□ 3.21
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35■■■■□ 3.19
HERC3-205ENST00000426683 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.13
HERC3-205ENST00000426683 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.44■■■■□ 3.1
HERC3-205ENST00000426683 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.24■■■■□ 3.07
HERC3-205ENST00000426683 SMARCA4P51532 1647 aa33.93■■■■□ 3.02
HERC3-205ENST00000426683 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
HERC3-205ENST00000426683 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.79■■■■□ 3
HERC3-205ENST00000426683 NCAPD3P42695 1498 aa33.76■■■□□ 2.99
HERC3-205ENST00000426683 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.73■■■□□ 2.99
HERC3-205ENST00000426683 SMARCA2P51531 1590 aa33.72■■■□□ 2.99
HERC3-205ENST00000426683 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.59■■■□□ 2.97
HERC3-205ENST00000426683 HMGXB3Q12766 1538 aa33.57■■■□□ 2.96
HERC3-205ENST00000426683 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
HERC3-205ENST00000426683 WIZO95785 1651 aa33.35■■■□□ 2.93
HERC3-205ENST00000426683 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
HERC3-205ENST00000426683 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
HERC3-205ENST00000426683 NESP48681 1621 aa32.97■■■□□ 2.87
HERC3-205ENST00000426683 ERCC6Q03468 1493 aa32.85■■■□□ 2.85
HERC3-205ENST00000426683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.84■■■□□ 2.85
HERC3-205ENST00000426683 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.79■■■□□ 2.84
HERC3-205ENST00000426683 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.67■■■□□ 2.82
HERC3-205ENST00000426683 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.63■■■□□ 2.81
HERC3-205ENST00000426683 CFTRP13569 1480 aa32.58■■■□□ 2.81
HERC3-205ENST00000426683 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
HERC3-205ENST00000426683 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.52■■■□□ 2.8
HERC3-205ENST00000426683 CUX2O14529 1486 aa32.48■■■□□ 2.79
HERC3-205ENST00000426683 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
HERC3-205ENST00000426683 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.42■■■□□ 2.78
HERC3-205ENST00000426683 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.36■■■□□ 2.77
HERC3-205ENST00000426683 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.32■■■□□ 2.76
HERC3-205ENST00000426683 PRDM2Q13029 1718 aa32.23■■■□□ 2.75
HERC3-205ENST00000426683 WDR62O43379 1518 aa32.2■■■□□ 2.74
HERC3-205ENST00000426683 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HERC3-205ENST00000426683 TOPBP1Q92547 1522 aa31.89■■■□□ 2.7
HERC3-205ENST00000426683 ABCC8Q09428 1581 aa31.86■■■□□ 2.69
HERC3-205ENST00000426683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.83■■■□□ 2.69
HERC3-205ENST00000426683 IFT140Q96RY7 1462 aa31.69■■■□□ 2.66
HERC3-205ENST00000426683 CUX1P39880 1505 aa31.64■■■□□ 2.66
HERC3-205ENST00000426683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
HERC3-205ENST00000426683 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
HERC3-205ENST00000426683 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.54■■■□□ 2.64
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.52■■■□□ 2.64
HERC3-205ENST00000426683 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
HERC3-205ENST00000426683 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.51■■■□□ 2.63
HERC3-205ENST00000426683 SOGA1O94964 1423 aa31.5■■■□□ 2.63
HERC3-205ENST00000426683 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.45■■■□□ 2.63
HERC3-205ENST00000426683 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HERC3-205ENST00000426683 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.39■■■□□ 2.62
HERC3-205ENST00000426683 SYNJ1O43426 1573 aa31.35■■■□□ 2.61
HERC3-205ENST00000426683 TOP2BQ02880 1626 aa31.35■■■□□ 2.61
HERC3-205ENST00000426683 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
HERC3-205ENST00000426683 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.32■■■□□ 2.6
HERC3-205ENST00000426683 WDR97A6NE52 1622 aa31.24■■■□□ 2.59
HERC3-205ENST00000426683 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.23■■■□□ 2.59
HERC3-205ENST00000426683 OSCARQ8IYS5 282 aa31.17■■■□□ 2.58
HERC3-205ENST00000426683 GRIN2BQ13224 1484 aa31.13■■■□□ 2.57
HERC3-205ENST00000426683 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.13■■■□□ 2.57
HERC3-205ENST00000426683 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.09■■■□□ 2.57
HERC3-205ENST00000426683 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.09■■■□□ 2.57
HERC3-205ENST00000426683 FBLN2P98095 1184 aa31.05■■■□□ 2.56
HERC3-205ENST00000426683 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
HERC3-205ENST00000426683 PBRM1Q86U86 1689 aa31■■■□□ 2.55
HERC3-205ENST00000426683 CHD1O14646 1710 aa30.98■■■□□ 2.55
HERC3-205ENST00000426683 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
HERC3-205ENST00000426683 SYNJ2O15056 1496 aa30.92■■■□□ 2.54
HERC3-205ENST00000426683 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.84■■■□□ 2.53
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS12P58397 1594 aa30.8■■■□□ 2.52
HERC3-205ENST00000426683 KIF27Q86VH2 1401 aa30.8■■■□□ 2.52
HERC3-205ENST00000426683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.77■■■□□ 2.52
HERC3-205ENST00000426683 TRIM41Q8WV44 630 aa30.73■■■□□ 2.51
HERC3-205ENST00000426683 GRIN2AQ12879 1464 aa30.72■■■□□ 2.51
HERC3-205ENST00000426683 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.68■■■□□ 2.5
HERC3-205ENST00000426683 IGF1RP08069 1367 aa30.67■■■□□ 2.5
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF11O15085 1522 aa30.63■■■□□ 2.49
HERC3-205ENST00000426683 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.62■■■□□ 2.49
HERC3-205ENST00000426683 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.62■■■□□ 2.49
HERC3-205ENST00000426683 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.62■■■□□ 2.49
HERC3-205ENST00000426683 NUP160Q12769 1436 aa30.58■■■□□ 2.49
HERC3-205ENST00000426683 CEP170Q5SW79 1584 aa30.56■■■□□ 2.48
HERC3-205ENST00000426683 CUL7Q14999 1698 aa30.54■■■□□ 2.48
HERC3-205ENST00000426683 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.52■■■□□ 2.48
HERC3-205ENST00000426683 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.5■■■□□ 2.47
HERC3-205ENST00000426683 ARAP1Q96P48 1450 aa30.4■■■□□ 2.46
HERC3-205ENST00000426683 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.4■■■□□ 2.46
HERC3-205ENST00000426683 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.34■■■□□ 2.45
HERC3-205ENST00000426683 SHROOM2Q13796 1616 aa30.32■■■□□ 2.44
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