Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS3Q99687 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS3Q99687 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms