Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.481e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.481e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.521e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.521e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 36.74□□□□□ -1.331e-7■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 519.21■□□□□ 0.672e-8■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 39.94□□□□□ -0.822e-8■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 57.66□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 57.66□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 55.2□□□□□ -1.582e-8■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.016e-18■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 FKBP10-206ENST00000489591 2826 ntTSL 214.12□□□□□ -0.156e-18■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 FKBP10-203ENST00000455106 1965 ntTSL 212.43□□□□□ -0.426e-18■■□□□ 13.8
SRSF7Q16629 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.375e-6■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 CTNND1-238ENST00000534647 866 ntTSL 58.89□□□□□ -0.999e-11■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 STMN1-208ENST00000485226 449 ntTSL 25.17□□□□□ -1.581e-6■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-11■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.721e-11■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 ARGLU1-201ENST00000360629 361 ntTSL 23.4□□□□□ -1.871e-11■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 55.2□□□□□ -1.582e-7■■□□□ 13.7
SRSF7Q16629 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.657e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-206ENST00000417435 970 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-218ENST00000494170 969 ntTSL 311.77□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.542e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 411.31□□□□□ -0.62e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-212ENST00000475943 860 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 310.31□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 SEL1L3-210ENST00000513416 2344 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 37.12□□□□□ -1.272e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-203ENST00000393529 794 ntTSL 56.67□□□□□ -1.342e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.392e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 24.89□□□□□ -1.632e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 SLC17A9-206ENST00000487303 507 ntTSL 212.94□□□□□ -0.344e-36■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-8■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-8■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 13.6
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SRSF7Q16629 ANKRD10-208ENST00000485844 641 ntTSL 26.37□□□□□ -1.391e-8■■□□□ 13.6
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SRSF7Q16629 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 222.42■■□□□ 1.181e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.731e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.561e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.361e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZFAS1-210ENST00000623640 732 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-7■■□□□ 13.6
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SRSF7Q16629 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.51e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 25.65□□□□□ -1.51e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.141e-7■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.042e-7■■□□□ 13.5
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SRSF7Q16629 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-7■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 ATXN1-210ENST00000498374 1648 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.382e-7■■□□□ 13.5
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SRSF7Q16629 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.348e-8■■□□□ 13.5
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SRSF7Q16629 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 58.45□□□□□ -1.068e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 SRSF5-202ENST00000553369 613 ntTSL 28.06□□□□□ -1.128e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.198e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 57.38□□□□□ -1.238e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.298e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.328e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.458e-8■■□□□ 13.5
SRSF7Q16629 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.033e-13■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.844e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 RING1-202ENST00000478431 1532 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.84e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-11■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.254e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-214ENST00000483222 2091 ntTSL 516.31■□□□□ 0.24e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-204ENST00000429374 1634 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-221ENST00000498366 2153 ntTSL 515.43■□□□□ 0.064e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 215.4■□□□□ 0.064e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.054e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-218ENST00000496909 732 ntTSL 314.93□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-215ENST00000488270 715 ntTSL 314.93□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-206ENST00000417682 1817 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 HDAC10-206ENST00000454936 1922 ntTSL 214.29□□□□□ -0.124e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 213.96□□□□□ -0.174e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.244e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-228ENST00000524296 2108 ntTSL 513.51□□□□□ -0.254e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.394e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-217ENST00000466991 545 ntTSL 512.22□□□□□ -0.454e-6■■□□□ 13.4
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