Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms