RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf106-201ENST00000316786 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.86■■□□□ 1.09
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C9orf106-201ENST00000316786 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.71■■□□□ 1.07
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C9orf106-201ENST00000316786 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.8■□□□□ 0.92
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C9orf106-201ENST00000316786 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C9orf106-201ENST00000316786 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.79■□□□□ 0.92
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C9orf106-201ENST00000316786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.77■□□□□ 0.91
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C9orf106-201ENST00000316786 KIF27Q86VH2 1401 aa20.74■□□□□ 0.91
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C9orf106-201ENST00000316786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
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C9orf106-201ENST00000316786 CLIP1P30622 1438 aa20.59■□□□□ 0.89
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C9orf106-201ENST00000316786 WDR97A6NE52 1622 aa20.38■□□□□ 0.85
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C9orf106-201ENST00000316786 BCL11AQ9H165 835 aa20.31■□□□□ 0.84
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C9orf106-201ENST00000316786 ERCC6Q03468 1493 aa20.31■□□□□ 0.84
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C9orf106-201ENST00000316786 CUL7Q14999 1698 aa20.25■□□□□ 0.83
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