Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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HERC6Q8IVU3 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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