Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCLCP48506 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLCP48506 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLCP48506 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLCP48506 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms