Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms