RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289749.6

NBL1-201, Transcript of NBL1, DAN family BMP antagonist, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NBL1, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1-201ENST00000289749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.73■■■■□ 3.79
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NBL1-201ENST00000289749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
NBL1-201ENST00000289749 NACADO15069 1562 aa32.24■■■□□ 2.75
NBL1-201ENST00000289749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.24■■■□□ 2.75
NBL1-201ENST00000289749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.2■■■□□ 2.75
NBL1-201ENST00000289749 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.09■■■□□ 2.73
NBL1-201ENST00000289749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.05■■■□□ 2.72
NBL1-201ENST00000289749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.64■■■□□ 2.66
NBL1-201ENST00000289749 SCRIBQ14160 1630 aa31.4■■■□□ 2.62
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NBL1-201ENST00000289749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.33■■■□□ 2.45
NBL1-201ENST00000289749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.24■■■□□ 2.43
NBL1-201ENST00000289749 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.13■■■□□ 2.41
NBL1-201ENST00000289749 SMARCA4P51532 1647 aa30.05■■■□□ 2.4
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NBL1-201ENST00000289749 SMARCA2P51531 1590 aa29.77■■■□□ 2.36
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NBL1-201ENST00000289749 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.73■■■□□ 2.35
NBL1-201ENST00000289749 NCAPD3P42695 1498 aa29.68■■■□□ 2.34
NBL1-201ENST00000289749 HMGXB3Q12766 1538 aa29.62■■■□□ 2.33
NBL1-201ENST00000289749 WIZO95785 1651 aa29.61■■■□□ 2.33
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NBL1-201ENST00000289749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.93■■■□□ 2.22
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NBL1-201ENST00000289749 PRDM2Q13029 1718 aa28.74■■■□□ 2.19
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NBL1-201ENST00000289749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.72■■■□□ 2.19
NBL1-201ENST00000289749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.68■■■□□ 2.18
NBL1-201ENST00000289749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.54■■■□□ 2.16
NBL1-201ENST00000289749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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NBL1-201ENST00000289749 CUX2O14529 1486 aa28.34■■■□□ 2.13
NBL1-201ENST00000289749 WDR62O43379 1518 aa28.31■■■□□ 2.12
NBL1-201ENST00000289749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
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NBL1-201ENST00000289749 TOPBP1Q92547 1522 aa28.12■■■□□ 2.09
NBL1-201ENST00000289749 ABCC8Q09428 1581 aa28.11■■■□□ 2.09
NBL1-201ENST00000289749 CUX1P39880 1505 aa28.01■■■□□ 2.07
NBL1-201ENST00000289749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
NBL1-201ENST00000289749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.89■■■□□ 2.05
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NBL1-201ENST00000289749 WDR97A6NE52 1622 aa27.71■■■□□ 2.03
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NBL1-201ENST00000289749 CHD1O14646 1710 aa27.36■■□□□ 1.97
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NBL1-201ENST00000289749 NUP160Q12769 1436 aa26.92■■□□□ 1.9
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NBL1-201ENST00000289749 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
NBL1-201ENST00000289749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.81■■□□□ 1.88
NBL1-201ENST00000289749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.81■■□□□ 1.88
NBL1-201ENST00000289749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.81■■□□□ 1.88
NBL1-201ENST00000289749 PRXQ9BXM0 1461 aa26.81■■□□□ 1.88
NBL1-201ENST00000289749 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.8■■□□□ 1.88
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