Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETP07949 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETP07949 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETP07949 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETP07949 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms